Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNAL1Q9UBT7 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms