Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms