Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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