Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB6

PARD6A, Partitioning defective 6 homolog alpha, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6AQ9NPB6 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms