Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHE41Q9C0J9 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms