Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms