Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D3

ZYG11B, Protein zyg-11 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZYG11BQ9C0D3 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZYG11BQ9C0D3 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms