Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms