Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms