Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms