Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms