Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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SEC22CQ9BRL7 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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SEC22CQ9BRL7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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SEC22CQ9BRL7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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SEC22CQ9BRL7 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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SEC22CQ9BRL7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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