Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FYCO1Q9BQS8 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms