Protein–RNA interactions for Protein: Q96NJ3

ZNF285, Zinc finger protein 285, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF285Q96NJ3 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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ZNF285Q96NJ3 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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ZNF285Q96NJ3 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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ZNF285Q96NJ3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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ZNF285Q96NJ3 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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ZNF285Q96NJ3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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ZNF285Q96NJ3 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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ZNF285Q96NJ3 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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ZNF285Q96NJ3 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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ZNF285Q96NJ3 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF285Q96NJ3 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.9 ms