Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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SGCZQ96LD1 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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