Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms