Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ5

CLIP3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP3Q96DZ5 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP3Q96DZ5 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms