Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA6Q92908 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms