Protein–RNA interactions for Protein: Q92537

SUSD6, Sushi domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD6Q92537 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD6Q92537 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms