Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU6

GPBAR1, G-protein coupled bile acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBAR1Q8TDU6 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
GPBAR1Q8TDU6 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPBAR1Q8TDU6 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.6 ms