Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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