Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

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Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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ZNF549Q6P9A3 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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ZNF549Q6P9A3 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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ZNF549Q6P9A3 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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ZNF549Q6P9A3 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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ZNF549Q6P9A3 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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ZNF549Q6P9A3 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF549Q6P9A3 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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