Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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C9orf135Q5VTT2 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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C9orf135Q5VTT2 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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C9orf135Q5VTT2 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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C9orf135Q5VTT2 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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