Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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PRAMEF20Q5VT98 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PRAMEF20Q5VT98 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PRAMEF20Q5VT98 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PRAMEF20Q5VT98 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PRAMEF20Q5VT98 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PRAMEF20Q5VT98 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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