Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms