Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITRM1Q5JRX3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITRM1Q5JRX3 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PITRM1Q5JRX3 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PITRM1Q5JRX3 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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