Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms