Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms