Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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