Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms