Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms