Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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CDSNQ15517 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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CDSNQ15517 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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CDSNQ15517 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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CDSNQ15517 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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CDSNQ15517 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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CDSNQ15517 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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CDSNQ15517 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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CDSNQ15517 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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CDSNQ15517 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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CDSNQ15517 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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CDSNQ15517 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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CDSNQ15517 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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CDSNQ15517 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
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CDSNQ15517 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
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CDSNQ15517 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CDSNQ15517 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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