Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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UBE3CQ15386 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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UBE3CQ15386 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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UBE3CQ15386 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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UBE3CQ15386 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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UBE3CQ15386 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBE3CQ15386 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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