Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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IRF4Q15306 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF4Q15306 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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IRF4Q15306 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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IRF4Q15306 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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IRF4Q15306 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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IRF4Q15306 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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