Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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LAPTM4AQ15012 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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LAPTM4AQ15012 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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LAPTM4AQ15012 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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LAPTM4AQ15012 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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LAPTM4AQ15012 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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LAPTM4AQ15012 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 METTL23-207ENST00000588783 1184 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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LAPTM4AQ15012 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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