Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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