Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms