Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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