Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP1Q13835 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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