Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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RUNX3Q13761 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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RUNX3Q13761 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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RUNX3Q13761 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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