Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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