Protein–RNA interactions for Protein: Q13636

RAB31, Ras-related protein Rab-31, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB31Q13636 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB31Q13636 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB31Q13636 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB31Q13636 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB31Q13636 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB31Q13636 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB31Q13636 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB31Q13636 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB31Q13636 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB31Q13636 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB31Q13636 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB31Q13636 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB31Q13636 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAB31Q13636 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
RAB31Q13636 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
RAB31Q13636 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
RAB31Q13636 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
RAB31Q13636 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
RAB31Q13636 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
RAB31Q13636 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms