Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTCH1Q13635 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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