Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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