Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CUL3Q13618 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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