Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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