Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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FOXE3Q13461 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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FOXE3Q13461 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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FOXE3Q13461 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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FOXE3Q13461 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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FOXE3Q13461 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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FOXE3Q13461 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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FOXE3Q13461 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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FOXE3Q13461 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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