Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 GPC4-201ENST00000370828 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 DOK4-210ENST00000566936 2851 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 CSF3R-201ENST00000331941 2375 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 STRA6-206ENST00000449139 2732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms