Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
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