Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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